اگر مایعات باید اتوکلاو شوند، مراحل کار تا حدی با مراحل جامد متفاوت است. چنین عقیم سازی ضروری می شود، به عنوان مثال، هنگامی که مواد مایع درگیر هستند که باید بالای 100 درجه سانتیگراد گرم شوند تا به نقطه جوش برسند. از مراحل زیر به عنوان راهنما برای این نوع استفاده کنید:
فاز گرمایش و زمان یکسان سازی
ابتدا باید دمای مشخص شده در مایع حاصل شود. این مرحله گرمایش نامیده می شود. در اینجا توجه به اندازه و سطح دستگاه امری ابتدایی است - در غیر این صورت خطر اتفاقاتی مانند جوشیدن، تأخیر در جوشیدن یا حتی ترکیدن ظرف وجود دارد.
برخی از اتوکلاوها اکنون به اندازه گیری دما در یک دستگاه مرجع برای تسهیل این مرحله مجهز شده اند. زمان سپری شده تا زمانی که دمای مخزن تحت فشار دستگاه برابر با دمای مایع شود، زمان تعادل نامیده می شود. پس از رسیدن به این تعادل، می توان مرحله عقیم سازی را شروع کرد.
این امر توسط استریل کردن واقعی مایع انجام می شود که باید با مقررات مطابقت داشته باشد. مرحله استریلیزاسیون زمانی شروع می شود که دمای مورد نظر در مخزن تحت فشار دستگاه برسد و تا سپری شدن دوره زمانی تعیین شده قبلی ادامه می یابد. زمان جبران هنوز به عنوان زمان عقیم سازی به حساب نمی آید!